Phim kể về hoạt động của 1 tổ chức bí mật chuyên quản lý, giám sát những người ngoài hành tinh trên trái đất (MIB) - Men In Black. Tình cờ chứng kiến một người ngoài hành tinh, nhân viên cảnh sát New York , James Edwards bỗng chốc trở thành đặc vụ J của MIB. Đi cùng với J là K - một đặc vụ kỳ cựu. Cùng lúc đó, một sinh vật ngoài hành tinh xuất hiện để đi tìm 1 thiên hà siêu nhỏ mang sức mạnh vô tận được giấu trong một chiếc vòng cổ của mèo. Nhiệm vụ của K và J là cứu Trái đất, đồng thời tiêu diệt con Bọ.